耶魯研究:基因檢測(cè)中的“不確定變異”或隱藏重要線索-肽度TIMEDOO

在許多未解的醫(yī)學(xué)難題背后,患者渴望得到明確的答案與有效的治療。對(duì)于懷疑患有先天性免疫缺陷(Inborn Errors of Immunity, IEIs)的患者而言,基因檢測(cè)能夠?yàn)閭€(gè)體化診療提供新方向。然而,檢測(cè)結(jié)果并非總能帶來清晰的答案。許多患者最終被告知存在意義未明的基因變異(Variants of Uncertain Significance, VUS)——科學(xué)家能夠檢測(cè)到這些DNA變化,但目前缺乏足夠證據(jù)判斷其有害或無害。

近日,耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院(Yale School of Medicine, YSM)研究團(tuán)隊(duì)在 Clinical Immunology 期刊發(fā)表的新研究指出,這些“不確定變異”并非應(yīng)被一概擱置,而可能蘊(yùn)含重要的臨床線索。

該研究的通訊作者、耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院風(fēng)濕病學(xué)、過敏與免疫學(xué)助理教授,同時(shí)也是耶魯醫(yī)學(xué)免疫缺陷項(xiàng)目主任的Junghee Jenny Shin醫(yī)學(xué)博士、哲學(xué)博士介紹,大約80%的IEI患者在基因檢測(cè)中會(huì)得到VUS結(jié)果,這一結(jié)論常令患者倍感挫敗。IEI患者自出生起便存在免疫系統(tǒng)缺陷或功能異常,往往會(huì)經(jīng)歷反復(fù)或嚴(yán)重感染、自身免疫病、炎癥性疾病,甚至某些癌癥。

“傳統(tǒng)指南要求醫(yī)生不能依據(jù)VUS進(jìn)行治療,所以大多數(shù)情況下我們會(huì)把這些結(jié)果擱置?!盨hin表示,“但臨床上我們常發(fā)現(xiàn),這些變異與患者的表現(xiàn)存在對(duì)應(yīng)關(guān)系。這讓我們思考,是否有更有價(jià)值的分類方式能夠幫助醫(yī)生和患者?!?/p>

在這項(xiàng)研究中,第一作者、耶魯醫(yī)院住院醫(yī)師Samantha Novotny醫(yī)學(xué)博士收集并整理了患者的遺傳學(xué)、免疫學(xué)和臨床資料,并建立了數(shù)據(jù)庫。研究團(tuán)隊(duì)在其中識(shí)別出200多個(gè)VUS,并按照基因功能進(jìn)行聚類。結(jié)果顯示,不同功能基因的VUS與患者的具體臨床表現(xiàn)存在一定關(guān)聯(lián)性。

其中最強(qiáng)的相關(guān)性出現(xiàn)在與適應(yīng)性免疫系統(tǒng)相關(guān)的VUS

  • B細(xì)胞相關(guān)VUS:患者更容易出現(xiàn)反復(fù)呼吸道感染,并常常需要接受免疫球蛋白替代治療。

  • T細(xì)胞相關(guān)VUS:患者更傾向于出現(xiàn)免疫系統(tǒng)過度活躍及自身免疫性問題,這與T細(xì)胞在調(diào)控免疫反應(yīng)中的作用相符。

這是首個(gè)在IEI患者中通過聚類方式分析VUS并尋找其臨床聯(lián)系的研究。過去大多數(shù)相關(guān)研究側(cè)重于功能實(shí)驗(yàn),即在實(shí)驗(yàn)室中直接編輯候選基因以驗(yàn)證某一變異的影響。

Shin強(qiáng)調(diào):“功能實(shí)驗(yàn)仍是金標(biāo)準(zhǔn),但在日常臨床中難以操作。我們的研究并不能替代功能驗(yàn)證,也不能直接定義某個(gè)變異的臨床意義。但通過整體分析,我們能夠發(fā)現(xiàn)值得進(jìn)一步探索的模式,從而更接近為患者找到更合適的治療方案?!?/p>

這項(xiàng)研究匯聚了耶魯醫(yī)學(xué)院多個(gè)部門的力量,尤其是臨床過敏與免疫學(xué)團(tuán)隊(duì)的跨學(xué)科合作。Shin表示:“這是一次真正的團(tuán)隊(duì)努力。我們將臨床中的疑問轉(zhuǎn)化為研究中的洞見,這不僅推動(dòng)了科學(xué)探索,也讓我們更接近理解和幫助患者?!?/p>

參考文獻(xiàn):Samantha Novotny et al, Association of clinical manifestations and immune alterations with genetic variants of uncertain significance in patients concerned for inborn errors of immunity,?Clinical Immunology?(2025).?DOI: 10.1016/j.clim.2025.110513

編輯:周敏

排版:李麗