廣東省微生物研究所發(fā)現(xiàn)一批可能對(duì)新型冠狀病毒 2019-nCoV具有阻斷作用的已上市藥物
由廣東省微生物研究所雍天喬和陳地靈博士領(lǐng)銜的課題小組,就目前武漢爆發(fā)的新型冠狀病毒2019-nCoV疫情,開(kāi)展了抗2019-nCoV病毒潛力藥物計(jì)算機(jī)輔助模型篩選研究。武漢病毒肺炎爆發(fā)是由新型冠狀病毒2019-nCoV感染引起。2019-nCoV胞膜刺突(S)蛋白通過(guò)結(jié)合ACE2入侵宿主,決定該病毒的宿主親和性和進(jìn)入宿主細(xì)胞的能力,是預(yù)防和治療藥物開(kāi)發(fā)的關(guān)鍵靶標(biāo)。它含有S1和S2亞基,在病毒胞膜上形成二聚刺突結(jié)構(gòu)。這里,我們采用同源建模的方法模擬了武漢2019-nCoV激活情況下胞膜刺突(S)蛋白結(jié)構(gòu),明確了它的藥物口袋,篩選得到數(shù)個(gè)可能的阻斷劑。武漢2019-nCoV胞膜刺突(S)蛋白結(jié)構(gòu)與其它冠狀病毒類(lèi)似,結(jié)合肽段(CTD1,C端結(jié)構(gòu)域1)是其活性位點(diǎn),是藥物和抗體開(kāi)發(fā)潛在的靶點(diǎn)。我們以FDA批準(zhǔn)藥物分子庫(kù)為研究對(duì)象,以CTD1結(jié)構(gòu)域?yàn)榛钚园悬c(diǎn),采用分子對(duì)接的方法,以老藥新用的方式得到數(shù)個(gè)2019-nCoV病毒感染的潛在阻斷劑(詳細(xì)見(jiàn)表1),其中醋酸阿托西班得分最高達(dá)到8.09314,建議在2019-nCoV感染肺炎患者臨床治療中予以考慮和關(guān)注。研究課題小組后續(xù)將繼續(xù)深入開(kāi)展針對(duì)性的抗2019-nCoV活性測(cè)試,為臨床研究和治療提供更加直接的指導(dǎo)。
廣東省微生物研究所發(fā)現(xiàn)一批可能對(duì)新型冠狀病毒 2019-nCoV具有阻斷作用的已上市藥物-肽度TIMEDOO
圖1 模擬的2019-nCoV胞膜刺突結(jié)構(gòu)和2019-nCoV與ACE2結(jié)合口袋
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圖2?分子模擬可視化篩選得到的配體醋酸阿托西班與2019-nCoV結(jié)合情況,形成了8個(gè)氫鍵廣東省微生物研究所發(fā)現(xiàn)一批可能對(duì)新型冠狀病毒 2019-nCoV具有阻斷作用的已上市藥物-肽度TIMEDOO
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表1 以FDA已批準(zhǔn)化合物庫(kù)為配體進(jìn)行分子對(duì)接得到的可能具有阻斷2019-nCoV與ACE2結(jié)合的抑制劑(TOP20)來(lái)源:廣東省微生物研究所