Cell Death & Disease:研究揭示miR-133a的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制及其在細(xì)胞分化中的作用
近日,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Cell Death & Disease發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所衛(wèi)濤濤課題組與美國(guó)Creighton大學(xué)屠亞平課題組的合作論文,這是衛(wèi)濤濤課題組與屠亞平課題組長(zhǎng)期合作所取得的又一成果。研究人員發(fā)現(xiàn),miR-133a表達(dá)的上調(diào)促進(jìn)了線粒體生物發(fā)生和肌細(xì)胞分化,并進(jìn)一步通過(guò)“定向染色質(zhì)構(gòu)象捕獲”(CAPTURE)技術(shù)找到了調(diào)控miR-133a表達(dá)的上游調(diào)控因子KAP1,從而加深了對(duì)miR-133a轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制及重要功能的了解。
microRNA(miRNA)在多種生理及病理生理過(guò)程中起著重要的調(diào)控作用。在前期工作中,衛(wèi)濤濤課題組與屠亞平課題組密切合作,通過(guò)分子、細(xì)胞及動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證明,TGF-β1誘導(dǎo)表達(dá)的miR-133a可通過(guò)負(fù)反饋調(diào)節(jié)的方式作用于TGF-β1受體及其效應(yīng)分子,負(fù)調(diào)控TGF-β1信號(hào)通路,從而抑制甚至部分逆轉(zhuǎn)特發(fā)性肺纖維化(IPF)的進(jìn)程,相關(guān)論文于2019年9月11日發(fā)表于Cell Death & Disease雜志。
鑒于miR-133a的重要生理及病理生理學(xué)作用,探明其調(diào)控機(jī)制將對(duì)治療肺纖維化等相關(guān)疾病提供重要的線索。衛(wèi)濤濤課題組與屠亞平課題組進(jìn)一步以成肌細(xì)胞分化過(guò)程中miR-133a動(dòng)態(tài)表達(dá)為模型,使用基于CRISPR/Cas9的CAPTURE技術(shù),結(jié)合高通量測(cè)序及生物信息學(xué)分析,系統(tǒng)研究了miR-133a表達(dá)的調(diào)控機(jī)制,發(fā)現(xiàn)KAP1相關(guān)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控復(fù)合物可抑制C2C12成肌細(xì)胞中miR-133a的表達(dá);敲低KAP1可增加miR-133a的表達(dá),此過(guò)程伴隨線粒體生物發(fā)生和C2C12成肌細(xì)胞分化;miR-133a的上調(diào)足以誘導(dǎo)線粒體生物發(fā)生和C2C12成肌細(xì)胞分化,而miR-133a抑制劑則顯著抑制細(xì)胞分化。
該研究首次使用CAPTURE技術(shù)鑒定了細(xì)胞分化過(guò)程中調(diào)控miR-133a表達(dá)的重要因子,為理解microRNA的精確調(diào)控機(jī)制提供了新思路。
衛(wèi)濤濤課題組博士生張佳齡為論文第一作者,衛(wèi)濤濤、屠亞平為論文通訊作者。該研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、生物大分子國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的資助。
圖1. 用“定向染色質(zhì)構(gòu)象捕獲”技術(shù)富集與miR-133a基因上游調(diào)控區(qū)域結(jié)合的調(diào)控蛋白,質(zhì)譜鑒定發(fā)現(xiàn)KAP1等轉(zhuǎn)錄抑制因子可結(jié)合于miR-133a基因上游區(qū)域(A);過(guò)表達(dá)KAP1下調(diào)miR-1/133a的表達(dá),而敲低KAP1促進(jìn)miR-1/133a的表達(dá)(B)。
圖2. miR-133a顯著增加線粒體的膜電位(A),通過(guò)PGC-1 /Nrf1途徑上調(diào)多種線粒體電子傳遞復(fù)合體亞基的表達(dá)(B),并增強(qiáng)線粒體的氧化磷酸化(C)。
來(lái)源: 生物物理研究所

