新的一年新的起點，科研人繼續(xù)踏上研究新征程！本周學(xué)術(shù)君繼續(xù)帶來最新一周的 CNS （Cell&Nature&Science）進展，助力大家勇攀科研高峰，開啟新年新氣象！1.?Cell Reports：尿液蛋白助力區(qū)分輕重型新冠肺炎鑒定尿液分子表型有利于迅速診斷新冠病毒的變異程度。2021 年 12 月 27 日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院郭天南團隊在Cell Reports雜志發(fā)表了研究論文“Proteomic and metabolomic profiling of urine uncovers immuneresponses in patients with COVID-19”。該研究表明新冠肺炎病人的尿液能夠靈敏地反映機體的病理狀態(tài)，利用蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)技術(shù)從尿液中篩選出 20 個蛋白質(zhì)標(biāo)志物并建立模型，達到了對新冠患者進行輕重型分類預(yù)測的目的，并指出病毒可能損傷新冠肺炎病人的腎臟健康！“亭亭山上松，瑟瑟谷中風(fēng)”。中國松一直是詩人們稱頌的絕佳對象。2021 年 12 月 29 日，北京林業(yè)大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院副教授鈕世輝聯(lián)合多個團隊聯(lián)合在?Cell?雜志發(fā)表論文“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”。該研究以我國特有的鄉(xiāng)土針葉樹種——油松為研究對象，發(fā)現(xiàn)油松中具有極高的DNA 甲基化水平，揭示了油松演化關(guān)鍵特征的遺傳基礎(chǔ)，為深入理解針葉樹演化機制，保護針葉樹資源提供了重要參考！3.?Developmental Cell：兩性之爭始于子宮時期胎盤給予嬰兒充足的營養(yǎng)和氧氣，然而胎兒如何通過控制胎盤發(fā)育的節(jié)奏幫助自身發(fā)育的機制尚不明確。2021 年 12 月 27 日，英國劍橋大學(xué)Miguel教授團隊在Developmental Cell雜志發(fā)表研究論文“The imprinted Igf2-Igf2r axis is critical for matching placental microvasculature expansion to fetal growth”。
該研究發(fā)現(xiàn)印跡基因軸是控制妊娠晚期胎盤血管發(fā)育擴張的重要途徑，揭示了胎盤發(fā)育的關(guān)鍵功能調(diào)節(jié)因子是胎兒源性信號，發(fā)現(xiàn)父系基因驅(qū)動胎兒對更多營養(yǎng)和更大血管的需求，而母系基因則控制著營養(yǎng)供應(yīng)量！4.?Cell：解析 mRNA 疫苗對新冠肺炎有效的原因疫情在全世界肆虐已有兩年，mRNA疫苗在預(yù)防新冠病毒感染方面有效率超過 90%。2021 年 12 月 23 日，華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院研究人員在Cell?雜志發(fā)表研究論文“SARS-CoV-2 mRNA vaccination elicits a robust and persistent T follicular helper cell response in humans”。該研究發(fā)現(xiàn)輝瑞等醫(yī)藥公司生產(chǎn)的mRNA 疫苗，能夠強烈而持久地激活濾泡輔助性T細(xì)胞，推動免疫細(xì)胞記憶的發(fā)展，進而強效抵御突變新冠病毒。5.?Cell：癌癥分型可助力臨床上有效確定治療靶點惡性腫瘤令無數(shù)人失去生命，如何對其早診斷、早治療是臨床亟需解決的問題。2021 年 12 月 27 日，美國加利福尼亞大學(xué)Matthew F. Krummel 教授團隊在Cell?雜志上發(fā)表研究論文“Discovering dominant tumor immune archetypes in a pan-cancer census”。該研究聚焦 364 位惡性腫瘤患者、12 種癌癥類型，利用深度轉(zhuǎn)錄組測序和流式細(xì)胞術(shù)確定了癌癥免疫成分的主要模式，發(fā)現(xiàn)顯性腫瘤免疫原性可有效地確定癌癥治療靶點，助力人類早日攻克癌癥！6.?Nature Ecology & Evolution：揭示多態(tài)性重復(fù)基因的基因組演化機制關(guān)于劑量敏感性和內(nèi)含子在遺傳進化中的重要作用研究甚少。2021 年 12 月 30 日，中國科學(xué)院動物研究所張勇團隊在Nature Ecology & Evolution?雜志上發(fā)表了研究論文”Dosage sensitivity and exon shuffling shape the landscape of polymorphic duplicates in Drosophila and humans“。該研究以 6 個果蠅品系和人類數(shù)據(jù)庫 GTEx 為模型，將重復(fù)基因分為完整重復(fù)基因、部分重復(fù)基因和內(nèi)含子重復(fù)基因，系統(tǒng)地將基因重復(fù)和外顯子洗牌融合到一起，勾勒了劑量敏感性和外顯子洗牌共同塑造重復(fù)基因演化的動態(tài)過程！（圖源：?Nature Ecology & Evolution）7.?Cancer Cell：多組學(xué)研究聯(lián)合繪制肝內(nèi)膽管癌的分子特征圖譜肝內(nèi)膽管癌是世界第二高發(fā)的肝臟類惡性腫瘤。2021 年 12 月 30 日，復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士等多個課題組聯(lián)合在Cancer Cell?雜志上發(fā)表研究論文“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”。該研究獲得了 262 例肝內(nèi)膽管癌患者癌組織的全外顯子組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、磷酸化組、微生物組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，系統(tǒng)地繪制了肝內(nèi)膽管癌的多維分子圖譜，發(fā)現(xiàn) TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1 突變（融合）可驅(qū)動肝內(nèi)膽管癌的發(fā)生！8.?Nature：飲食控制纈氨酸攝入，聯(lián)合藥物治療，有抗癌之效如何有效抗癌一直是科研界極其關(guān)注的問題。2021 年 12 月 21 日，美國紐約大學(xué)醫(yī)學(xué)院Iannis Aifantis團隊在Nature雜志發(fā)表研究論文“Valine tRNA levels and availability regulate complex I assembly in leukaemia”。該研究通過建立腫瘤小鼠模型，發(fā)現(xiàn)與纈氨酸相關(guān)的tRNA會明顯受到NOTCH1基因的影響而上調(diào)，且給小鼠飲食中添加纈氨酸會重新激活腫瘤生長，該研究指出控制纈氨酸攝入外加藥物治療或可有效治療癌癥！9.?Hepatology：發(fā)現(xiàn)新的潛在治療肝纖維化的策略肝纖維化嚴(yán)重會導(dǎo)致肝臟失去正常生理功能，當(dāng)目前尚沒有有效治療肝纖維化的辦法。2021 年 12 月 23 日，南方醫(yī)科大學(xué)周偉杰團隊在Hepatology雜志發(fā)表研究論文“A New Strategy of Vascular-targeted Therapy for Liver Fibrosis”。該研究使用四氯化碳誘導(dǎo)的小鼠肝纖維化模型和非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型，發(fā)現(xiàn)不同的肝血管在肝纖維過程中表現(xiàn)出不同的變化和作用，使用 AAV9-LECT2-shRNA 和貝伐單抗的組合治療能夠改善肝纖維化，減少藥物副作用！10.?Nature?Plants：揭示植物干旱條件下根莖比變化的機理干旱脅迫環(huán)境下植物的根莖比會增加。2021 年 12 月 23 日，中國科學(xué)院上海植物逆境生物學(xué)研究中心趙楊團隊在Nature Plants雜志發(fā)表研究論文“Phosphorylation of SWEET sucrose transporters regulates plant root:shoot ratio under drought”。該研究發(fā)現(xiàn)滲透脅迫可增強植物長距離的蔗糖轉(zhuǎn)運，通過依賴于脫落酸的方式增加根莖比，發(fā)現(xiàn)表達 SWEET11 或 12 磷酸化模擬突變的轉(zhuǎn)基因植物具有更頑強的生命力！（圖源：Nature Plants）
[1]Xiaojie Bi et al. Proteomic and metabolomic profiling of urine uncovers immune responses in patients with COVID-19. Cell reports (2021). https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.110271
[2]ShihuiNiu et al. The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution. Cell (2021). https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.006
[3]Ionel Sandovici et al. The imprinted Igf2-Igf2r axis is critical for matching placental microvasculature expansion to fetal growth. Developmental Cell (2021). https://doi.org/10.1016/j.devcel.2021.12.005
[4]Philip A. Mudd et al. SARS-CoV-2 mRNA vaccination elicits a robust and persistent T follicular helper cell response in humans. Cell (2021). https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.026
[5]Alexis J.Combes et al. Discovering dominant tumor immune archetypes in a pan-cancer census. Cell (2021). https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.004
[6]Zhang, D., Leng, L., Chen, C. et al. Dosage sensitivity and exon shuffling shape the landscape of polymorphic duplicates in Drosophila and humans. Nat Ecol Evol (2021). https://doi.org/10.1038/s41559-021-01614-w
[7]Dong L, Lu D, Chen R, et al. Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma. Cancer Cell. 2021 Dec 28:S1535-6108(21)00659-0. doi: 10.1016/j.ccell.2021.12.006. Epub ahead of print. PMID: 34971568.
[8]Thandapani P, Kloetgen A, Witkowski MT, et al. Valine tRNA levels and availability regulate complex I assembly in leukaemia. Nature. 2021 Dec 22. doi: 10.1038/s41586-021-04244-1. Epub ahead of print. PMID: 34937946.
[9]Lin Y, Dong MQ, Liu ZM, et al. A New Strategy of Vascular-targeted Therapy for Liver Fibrosis. Hepatology. 2021 Dec 23. doi: 10.1002/hep.32299. Epub ahead of print. PMID: 34940991.
[10]Chen, Q., Hu, T., Li, X. et al. Phosphorylation of SWEET sucrose transporters regulates plant root:shoot ratio under drought. Nat. Plants (2021). https://doi.org/10.1038/s41477-021-01040-7
來源：丁香學(xué)術(shù)
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