6月開(kāi)班|實(shí)用生物信息學(xué)研討班2023年6月5-9日
生物信息學(xué)是一門新興的交叉學(xué)科，它的出現(xiàn)和發(fā)展，與生物技術(shù)的迅速發(fā)展密不可分。生物信息學(xué)可以幫助我們理解生命科學(xué)領(lǐng)域中的大量數(shù)據(jù)，包括基因、基因組、蛋白質(zhì)、代謝等多個(gè)層面的信息。掌握生物信息學(xué)的相關(guān)知識(shí)和技能，可以幫助我們更好地理解和解釋生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)，并為生命科學(xué)研究提供重要支持。
本期實(shí)用生物信息學(xué)研討班是一個(gè)系統(tǒng)、全面的培訓(xùn)課程，旨在幫助生物醫(yī)學(xué)研究者和生物信息學(xué)初學(xué)者全面掌握生物信息學(xué)相關(guān)的知識(shí)和技能，包括生物信息學(xué)和各組學(xué)知識(shí)以及多類測(cè)序數(shù)據(jù)的實(shí)例分析等。如有更多關(guān)注信息或是科研難點(diǎn)問(wèn)題，可與授課老師進(jìn)行互動(dòng)討論。
協(xié)辦單位：
北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心
云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地
北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地
舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓
課程安排：2023年6月5-9日（周一—周五）??上午9:30-12:00 ?下午13:30-17:00
| 日期 | 主題 | 內(nèi)容 | 備注 |
| 第一天 | 組學(xué)及生物信息學(xué)概述 | 1、組學(xué)研究概述（基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)及相關(guān)技術(shù)介紹）
2、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理 3、生物信息學(xué)背景知識(shí)介紹 |
理論 |
| Linux服務(wù)器使用入門 | 1、掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點(diǎn)講解）
2、掌握Linux環(huán)境下軟件的安裝使用 3、了解Shell腳本的編寫 |
實(shí)戰(zhàn) | |
| R語(yǔ)言入門 | 1、R語(yǔ)言簡(jiǎn)介
2、R語(yǔ)言安裝及配置 3、R語(yǔ)言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 4、R語(yǔ)言數(shù)據(jù)處理 5、R語(yǔ)言繪圖 |
理論+
實(shí)戰(zhàn) |
|
| 第二天 | 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 | 1、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動(dòng)態(tài)
2、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點(diǎn) 3、常用的轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序建庫(kù)技術(shù) 4、轉(zhuǎn)錄組分析方法介紹 |
理論 |
| 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作） | 1、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹及安裝
2、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對(duì)（重點(diǎn)講解） 3、表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解） |
理論+
實(shí)戰(zhàn) |
|
| 第三天 | 基因組重測(cè)序與數(shù)據(jù)分析 | 1、講解基因組重測(cè)序的概念、目的與應(yīng)用
2、結(jié)合實(shí)例講解其原理、數(shù)據(jù)類型與格式、操作流程、軟件等相關(guān)知識(shí) |
理論 |
| 基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作） | 1、對(duì)二代測(cè)序數(shù)據(jù)的解讀
2、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及數(shù)據(jù)過(guò)濾 3、使用BWA和Samtools進(jìn)行數(shù)據(jù)比對(duì)并對(duì)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行可視化（重點(diǎn)講解） 4、尋找SNP和Indel并進(jìn)行注釋（重點(diǎn)講解） 5、尋找結(jié)構(gòu)變異并對(duì)變異進(jìn)行注釋（重點(diǎn)講解） |
理論+
實(shí)戰(zhàn) |
|
| 第四天 | microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析 | 1、microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展
2、microRNA的生物學(xué)過(guò)程 3、microRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理 4、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解） 5、microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來(lái)的研究前景 6、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點(diǎn)講解） 7、近期文獻(xiàn) |
理論 |
| microRNA數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作） | 1、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
2、測(cè)序數(shù)據(jù)長(zhǎng)度分布計(jì)算 3、microRNA的預(yù)測(cè)（重點(diǎn)講解） 4、microRNA堿基偏好性計(jì)算 5、microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解） |
理論+
實(shí)戰(zhàn) |
|
| 第五天 | 10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析原理 | 1、單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)研究現(xiàn)狀及應(yīng)用
2、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及建庫(kù)測(cè)序原理（重點(diǎn)介紹10× Genomics） 3、空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及建庫(kù)測(cè)序原理 |
理論 |
| 10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析流程上機(jī)操作 | 1、10×單細(xì)胞軟件Cellranger處理測(cè)序原始數(shù)據(jù)實(shí)戰(zhàn)
2、R包Seurat細(xì)胞分群、umap、t-sne、marker基因篩選實(shí)戰(zhàn) |
實(shí)戰(zhàn) | |
| 蛋白結(jié)構(gòu)與互作分析 | 1、PyMOL
2、Cytoscape |
實(shí)戰(zhàn) |
注：內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會(huì)提前通知。
【報(bào)名費(fèi)用】
注冊(cè)費(fèi)：5400元/人（含當(dāng)期聽(tīng)課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi)（如有））。
【報(bào)名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；
2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；
3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；
老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。
【掃碼報(bào)名】
【咨詢請(qǐng)聯(lián)系】
李老師 vicolee2021（微信）
【注】開(kāi)始前一周會(huì)發(fā)送郵件通知；若未接到郵件通知，請(qǐng)電話咨詢。
本文系作者 @TIMEDOO 原創(chuàng)發(fā)布在 肽度TIMEDOO。未經(jīng)許可，禁止轉(zhuǎn)載。
