揭示線粒體蛋白DELE1的結(jié)構(gòu):潛在老年疾病治療途徑
近日,科學(xué)家們在斯克里普斯研究所發(fā)表的研究結(jié)果表明,線粒體蛋白結(jié)構(gòu)對于激活細(xì)胞的綜合性應(yīng)激反應(yīng)(ISR)至關(guān)重要,這是一條有助于細(xì)胞保持健康的關(guān)鍵途徑。研究人員認(rèn)為,這種由DELE1蛋白組成的線粒體結(jié)構(gòu)可能成為未來治療老年相關(guān)疾病的靶點(diǎn)。
該團(tuán)隊(duì)的研究成果發(fā)表在《自然結(jié)構(gòu)與分子生物學(xué)》雜志上,題為“DELE1寡聚促進(jìn)綜合性應(yīng)激反應(yīng)的激活”。
研究人員寫道:“線粒體是動(dòng)態(tài)的細(xì)胞小器官,不斷響應(yīng)細(xì)胞應(yīng)激。最近的研究表明,線粒體應(yīng)激通過釋放DELE1的蛋白水解片段從線粒體傳遞到細(xì)胞質(zhì),該片段與eIF2α激酶HRI結(jié)合,從而啟動(dòng)綜合性應(yīng)激反應(yīng)(ISR)信號傳導(dǎo)。”
“我們報(bào)告了人類DELE1 C端裂解產(chǎn)物的冷凍電子顯微鏡結(jié)構(gòu),它組裝成高階寡聚體。這個(gè)寡聚體由八個(gè)DELE1單體組成,通過兩組疏水性亞單位相互作用以D4對稱方式組裝。我們確定了參與DELE1寡聚化的關(guān)鍵氨基酸殘基,并通過突變研究在體外和細(xì)胞中確認(rèn)了它們在穩(wěn)定八聚體中的作用?!?/p>
“我們進(jìn)一步表明,組裝受損的DELE1突變體在誘導(dǎo)依賴HRI的細(xì)胞培養(yǎng)模型中激活I(lǐng)SR的能力受損。綜上所述,我們的發(fā)現(xiàn)為理解DELE1的活性以及它如何在線粒體受損后信號傳導(dǎo)以促進(jìn)ISR活性提供了分子洞察。”
該研究的第一作者楊杰博士是斯克里普斯研究所Gabriel Lander博士實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員。他表示:“理解這一信號通路的分子細(xì)節(jié)有可能幫助我們開發(fā)治療多種疾病的方法,比如神經(jīng)退行性疾病、癌癥和心臟疾病。”
應(yīng)對壓力并做出反應(yīng)是維持細(xì)胞功能和健康的關(guān)鍵。線粒體必須不斷感知和應(yīng)對壓力因素,比如病毒感染和缺鐵。然而,隨著人們年齡的增長,線粒體的這種能力會減弱。
斯克里普斯研究所Luke Wiseman實(shí)驗(yàn)室的研究生Kelsey Baron表示:“就像我們身體的其他部分一樣,線粒體也會變得稍微不那么高效。當(dāng)線粒體的生產(chǎn)力減少時(shí),細(xì)胞在對抗不同應(yīng)激因素時(shí)就沒有那么多能量,許多人認(rèn)為這是神經(jīng)退行的一個(gè)重要觸發(fā)因素?!?/p>
線粒體應(yīng)對應(yīng)激的一種方法是激活I(lǐng)SR。先前的研究表明,DELE1蛋白參與了激活這一綜合性應(yīng)激反應(yīng),但在此之前,關(guān)于蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)知之甚少。表征DELE1的結(jié)構(gòu)是理解和治療與線粒體應(yīng)激相關(guān)的疾病的關(guān)鍵一步。
研究人員聚焦于DELE1的一個(gè)片段——C端,已知它在啟動(dòng)ISR中起著積極作用。當(dāng)他們分離出這個(gè)片段時(shí),他們驚訝地發(fā)現(xiàn)它的重量比預(yù)期要大得多,這表明蛋白質(zhì)片段的多個(gè)副本正在結(jié)合在一起。通過電子顯微鏡,團(tuán)隊(duì)展示了這個(gè)蛋白質(zhì)復(fù)合物(或寡聚體)是一個(gè)高度對稱的圓柱體,由八個(gè)相同的片段組成,換句話說,是一個(gè)八聚體。
研究的共同高級作者之一,Gabriel Lander博士,在斯克里普斯研究所整合結(jié)構(gòu)與計(jì)算生物學(xué)系擔(dān)任教授,他表示:“它形成了這種更大的寡聚結(jié)構(gòu),完全出乎意料。就像兩只四腿蜘蛛,它們的腿交織在一起,形成了這種靈活的圓柱狀結(jié)構(gòu)?!?/p>
研究人員捕獲了超過12,000張八聚體的電子顯微鏡圖像,然后使用算法生成了三維結(jié)構(gòu)模型。然后,通過查看結(jié)構(gòu)中不同氨基酸(蛋白質(zhì)的構(gòu)建塊)的位置,他們能夠確定哪些氨基酸參與結(jié)合和組裝八聚體。
為了測試DELE1的這種寡聚化是否需要激活I(lǐng)SR,研究人員在一些關(guān)鍵氨基酸中引入了突變,破壞了DELE1結(jié)合在一起的能力。當(dāng)他們培養(yǎng)含有這種突變、不能寡聚化的DELE1版本的細(xì)胞時(shí),這些細(xì)胞無法激活I(lǐng)SR,這表明寡聚化對于激活這一應(yīng)激信號通路至關(guān)重要。
研究人員表示,下一步是找到利用這些結(jié)構(gòu)信息來操控這些途徑的方法,尤其是在不同疾病和障礙中。
參考文獻(xiàn):https://www.nature.com/articles/s41594-023-01061-0
編輯:王洪
排版:李麗


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