歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目，本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻24篇，下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進展。

1、circEPSTI1作為三陰性乳腺癌獨立預后因素的研究

論文標題：circEPSTI1 as a Prognostic Marker and Mediator of Triple-Negative Breast Cancer Progression.

雜志：Theranostics
影響因子：8.573

通訊作者單位：中山大學腫瘤醫(yī)院

三陰性乳腺癌（TNBC）是指癌組織免疫組織化學檢查結果為雌激素受體（ER）、孕激素受體（PR）和原癌基因Her-2均為陰性的乳腺癌。TNBC是侵襲性最強的乳腺癌類型，該疾病復發(fā)率高和致死率高。這類乳腺癌占所有乳腺癌病理類型的10.0%～20.8%，具有特殊的生物學行為和臨床病理特征，預后較其他類型差。廣州中山大學腫瘤醫(yī)院謝小明團隊發(fā)現(xiàn)circEPSTI1環(huán)狀RNA可通過miRNA sponge作用機制，通過競爭性吸附miR-4753和miR-6809后上調(diào)BCL11A的表達，促進三陰性乳腺癌（TNBC）細胞的增殖和降低凋亡功能，結合臨床資料分析發(fā)現(xiàn)，circEPSTI1可作為TNBC患者的獨立預后因素。該文詳細解讀請點擊circEPSTI1作為三陰性乳腺癌的預后標志物和介導因子

圖注：circEPSTI1在三陰性乳腺癌（TNBC）中的作用機制示意圖

2、實體瘤中circRNA的功能及臨床意義

論文標題：Function and clinical significance of circRNAs in solid tumors.

雜志：J Hematol Oncol
影響因子：7.33

通訊作者單位：蘇州大學附屬第三醫(yī)院

自1979年研究者第一次在真核細胞中發(fā)現(xiàn)circRNA到現(xiàn)在，circRNA研究并非一帆風順，最初被認為是基因轉錄過程中錯誤剪切產(chǎn)物。高通量測序和生物信息學技術的發(fā)展才真正揭開circRNA的神秘面紗，circRNA非但不是轉錄垃圾，而且在各種生命體中普遍存在，數(shù)量眾多，功能強大的一種5’和3’首尾相連不同于線性RNA的環(huán)形RNA分子，在生理疾病過程中扮演重要角色。該綜述盤點了circRNA的各種特點，生物形成機制假說、分子功能和研究策略，以及circRNA與不同實體瘤的關系及潛在的臨床價值，是一份很好的實體瘤circRNA研究快速入門文章。文章詳細解讀見本公眾號文章：circRNA在實體瘤中的功能和臨床意義的長篇綜述。

3、敲低circRNA.2837可通過調(diào)節(jié)神經(jīng)元自噬作用保護坐骨神經(jīng)損傷

論文標題：Silencing of circRNA.2837 Plays a Protective Role in Sciatic Nerve Injury by Sponging the miR-34 Family via Regulating Neuronal Autophagy

雜志：Mol Ther Nucleic Acids
影響因子：5.66

通訊作者單位：第二軍醫(yī)大學長征醫(yī)院

周圍神經(jīng)損傷（PNI）是一種常見的臨床問題，主要由創(chuàng)傷和外科手術引起，給患者造成長期經(jīng)濟和社會負擔。目前已知受損的周圍神經(jīng)有一個軸突再生的內(nèi)在能力，但功能恢復差。因此，越來越多的研究致力于開發(fā)有效的周圍神經(jīng)損傷治療。目前，周圍神經(jīng)損傷的臨床前研究主要在動物模型中進行，坐骨神經(jīng)損傷（SNI）模型是研究周圍神經(jīng)損傷最常用的實驗范例，使用SNI模型進行了許多實驗試圖在周圍神經(jīng)損傷后增加神經(jīng)再生和功能恢復。然而，現(xiàn)有的神經(jīng)損傷治療方法似乎不足，部分原因是對損傷后細胞和分子事件的理解不足。因此，提高對周圍神經(jīng)損傷后分子和分子間相互作用的理解仍然很重要。

目前越來越多研究表明circRNA在多種疾病中起著重要調(diào)控功能，但在周圍神經(jīng)損傷方面研究還有很多空白，本文研究者利用去核糖體建庫RNA-seq技術對大鼠SNI模型進行高通量測序，鑒定出4942個circRNA分子，并發(fā)現(xiàn)circRNA.2837環(huán)狀RNA分子存顯著差異，在受損坐骨神經(jīng)組織中下調(diào)。進一步研究該circRNA的功能和機制發(fā)現(xiàn)，circRNA.2837的下調(diào)通過誘導自噬減輕了坐骨神經(jīng)損傷。此外，熒光素酶報告基因?qū)嶒烇@示circRNA.2837可以與miR-34家族成員結合，包括miR-34a，miR-34b和miR-34c。circRNA.2837的沉默通過直接靶向miR-34a誘導神經(jīng)元中的自噬。綜合各項實驗證據(jù)表明，circRNA.2837可發(fā)揮ceRNA（競爭性內(nèi)源RNA）作用，通過吸附miR-34家族調(diào)節(jié)神經(jīng)元自噬。該研究結果表明，差異表達的circRNA.2837參與了坐骨神經(jīng)損傷的發(fā)病機制，環(huán)狀RNA在SNI中發(fā)揮調(diào)節(jié)功能，可作為SNI治療的潛在靶點。

圖注：circRNA.2837調(diào)節(jié)神經(jīng)元自噬作用保護坐骨神經(jīng)損傷作用機制示意圖

4、NanoString nCounter一種優(yōu)秀的circRNA定量技術

論文標題：Enzyme-free digital counting of endogenous circular RNA molecules in B-cell malignancies.

雜志：Lab Invest?影響因子：4.254

通訊作者單位：丹麥奧胡斯大學

在前期高通量實驗篩選多個差異circRNA后，進一步就是針對特定circRNA進行定量分析了，通常的PCR定量檢測，看似分子生物學一項基礎實驗技術，但由于circRNA的特殊環(huán)形結構，且circRNA數(shù)量眾多，可變剪切形式多樣（可參看環(huán)狀RNA的可變剪接研究又一新作），對circRNA的準確定量鑒定依然充滿挑戰(zhàn)，技術層面還有很多提升的空間。需要考慮的因素也相對較多，比如PCR前是否需要進行RNaseR消化，內(nèi)參如何選擇，引物設計技巧，如何識別circRNA“滾環(huán)擴增”等（可參看環(huán)狀RNA定量PCR技術詳解，環(huán)狀RNA研究實驗流程詳解）。本文研究者就選用了基于NanoString nCounter 熒光條形碼標記檢測技術實現(xiàn)circRNA絕對定量分析，該技術一次可檢測約800個circRNA的表達水平，通量上比定量PCR有明顯優(yōu)勢，且定量效果和檢測靈敏度也可以與定量PCR媲美，是一種不錯的選擇，該技術具體介紹可參看基于NanoString nCounter進行circRNA絕對定量。

文獻列表：