近日，位于Reichman大學(xué)Dina Recanati醫(yī)學(xué)院的Scojen合成生物學(xué)研究所宣布推出全球最大的人類癌癥及其他慢性疾病中的嵌合基因（基因融合）數(shù)據(jù)庫——ChiTaRS 8.0。該項目由Genomics and Computational Biology實(shí)驗室負(fù)責(zé)人、Frenkel-Morgenstern博士領(lǐng)銜，巴伊蘭大學(xué)Azrieli醫(yī)學(xué)院的博士生Dylan D’Souza和Olwumi Giwa共同參與。此項研究的成果已在《核酸研究》期刊上發(fā)表，標(biāo)志著嵌合基因研究領(lǐng)域的重大進(jìn)展，為癌癥治療的個性化方案制定提供了強(qiáng)有力的支持。

基因融合是指不同基因的片段結(jié)合在一起，這一現(xiàn)象對癌癥腫瘤的發(fā)展具有重要影響。基因融合產(chǎn)生的異常蛋白質(zhì)往往是疾病診斷的重要標(biāo)志，也可能成為新藥開發(fā)的潛在靶點(diǎn)。ChiTaRS 8.0數(shù)據(jù)庫目前包含超過47,000個RNA轉(zhuǎn)錄本和10萬多個在人類中識別的嵌合序列，為科學(xué)家提供了豐富的研究數(shù)據(jù)。

該數(shù)據(jù)庫的一個突出特點(diǎn)是與“數(shù)字化醫(yī)院”模型的結(jié)合，能夠?qū)崟r更新并納入新的臨床數(shù)據(jù)。這一功能使得醫(yī)生能夠根據(jù)患者的基因信息，設(shè)計個性化的癌癥治療方案，提高治療的精準(zhǔn)性和效果。

此外，ChiTaRS 8.0數(shù)據(jù)庫還為新藥研發(fā)提供了革命性的工具。通過與DGIdb數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)整合，科學(xué)家可以研究融合蛋白與現(xiàn)有藥物（如靶向癌癥促進(jìn)蛋白的抑制劑）之間的相容性，為未來的藥物開發(fā)提供參考。

Scojen合成生物學(xué)研究所所長Yosi Shaham-Diamand教授表示：“該數(shù)據(jù)庫還被開發(fā)為預(yù)測腫瘤對治療反應(yīng)的工具，有助于提高治療成功率并減少副作用。除了對全球研究的貢獻(xiàn)外，ChiTaRS 8.0還將促進(jìn)全球研究機(jī)構(gòu)間的合作，未來將整合更多復(fù)雜數(shù)據(jù)集并引入人工智能技術(shù)?！?/p>

Frenkel-Morgenstern博士指出：“這個數(shù)據(jù)庫是癌癥理解和治療的一個重要進(jìn)步。它是一個動態(tài)的研究工具，旨在改變癌癥診斷和治療的面貌。我們還計劃添加FDA批準(zhǔn)的藥物信息，這些藥物能夠與嵌合蛋白結(jié)合，并結(jié)合嵌合基因的表達(dá)水平，開發(fā)定制化的生物標(biāo)志物，以推動精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展?！?/p>

ChiTaRS 8.0的推出為癌癥研究和治療帶來了新的可能，也為全球醫(yī)學(xué)和生物學(xué)研究領(lǐng)域提供了重要的資源和平臺。

參考文獻(xiàn)：Dylan DSouza et al, ChiTaRS 8.0: the comprehensive database of chimeric transcripts and RNA-seq data with applications in liquid biopsy,?Nucleic Acids Research?(2024).?DOI: 10.1093/nar/gkae1126

編輯：王洪

排版：李麗