本文轉(zhuǎn)自:藍色彩虹

作者:戴名菡

人體微生物是構(gòu)成了人體自身外的另一套基因組。自2007年以來,科學(xué)展示了腸道微生物與人體健康方方面面的關(guān)聯(lián)。在美國,科研、臨床發(fā)展以及投資等多個方面的助力大大促進了微生物產(chǎn)業(yè)的進展。但是在中國,企業(yè)布局大部分在檢測及健康管理,產(chǎn)業(yè)化發(fā)展遇到瓶頸。通過分析國內(nèi)外產(chǎn)業(yè)現(xiàn)有的發(fā)展?fàn)顩r,我們希望能給出一些產(chǎn)業(yè)化方向的意見。
人體微生物與人體健康有著千絲萬縷的關(guān)系,未來在醫(yī)療方面的應(yīng)用市場廣泛

人體內(nèi)有兩個基因組,一個是從父母那里遺傳來的人類基因組;另一個則是出生以后才進入人體的共生微生物,其遺傳信息的總和叫微生物組。人體健康與微生物組關(guān)系密切。 基于目前的研究,腸道微生物或其代謝物對于宿主主要有三個功能:1)抵御病原體,預(yù)防感染;2)對食物進行消化和代謝,調(diào)節(jié)人體的新陳代謝;3)也是最復(fù)雜的功能,參與免疫系統(tǒng)的發(fā)育,加強免疫系統(tǒng)(圖1)1。

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圖1. 腸道微生物的三大功能

自2004 年以來,《自然》、《科學(xué)》等頂級學(xué)術(shù)刊物刊登了大量有關(guān)腸道菌群與疾病和健康關(guān)系的研究論文,包括肥胖、糖尿病、癌癥、自閉癥等在內(nèi)的超過50多種疾病,都與腸道菌群失調(diào)有關(guān)系,其因果關(guān)系也在逐步闡明中(圖2)。因此,腸道微生物在未來疾病方向上的應(yīng)用廣闊。

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圖2. 與腸道微生物相關(guān)的疾病

全球的重大研究計劃及科研熱度,為腸道微生物產(chǎn)業(yè)化打下了堅實的科研基礎(chǔ)

微生物與人體健康的緊密關(guān)系,引起了全球研究人員的關(guān)注,并在全球范圍啟動了幾項重大的研究計劃,大力推動了科研進展,也為產(chǎn)業(yè)化奠定了堅實的科研基礎(chǔ)(圖3,圖4)。

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圖3. 全球重要微生物組計劃

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圖4. 全球重要的腸道微生物科研計劃

根據(jù)pubmed的數(shù)據(jù)庫,微生物組學(xué)相關(guān)科研數(shù)量每年遞增,和microbiome相關(guān)的文獻從2008年的314篇到2017年的3875篇(圖5)。在所有國家中,美國微生物組學(xué)的文章遠遠領(lǐng)先,比排名第三的中國多出4-5倍7。

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圖5. 2008-2017期間Pubmed科研論文數(shù)量

數(shù)據(jù)來源:Pubmed, 關(guān)鍵詞為Microbiome OR Microbiota, 人類

在人體微生物組學(xué)中,96-99%的微生物聚集在胃腸道14,同時也是研究領(lǐng)域的重點方向。2008年到2018年10年的研究文獻中,腸道微生物相關(guān)的最多,達到6558篇,其次是口腔, 有2240篇(圖6)8。腸道微生物的科研進展快于其他領(lǐng)域,在一定程度上表示其產(chǎn)業(yè)化進展也將會較快于其他。

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圖6. 2008-2018年人體微生物文獻數(shù)量

數(shù)據(jù)來源:Pubmed

微生物的臨床發(fā)展火熱,其中消化道、代謝類疾病最受關(guān)注

臨床試驗方面,根據(jù)clinicaltrial.gov的數(shù)據(jù)庫顯示,和腸道微生物(gut microbiome)相關(guān)的,已完成或者進行中的臨床試驗有1429個,疾病研究領(lǐng)域最多的包括:消化道、腸胃、及代謝類疾病。 其中美國和歐洲的臨床數(shù)量最多,分別有414和532個8。

腸道微生物吸引了投資者的青睞,疾病的診斷和治療是投資熱點

自2006年起,各國啟動了微生物組計劃后,科研的進展大大推動了微生物的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展,同時吸引了大量的投資資金。微生物可應(yīng)用于健康,農(nóng)業(yè),環(huán)境等。人體健康方面,益生元和益生菌早已經(jīng)在食物和營養(yǎng)市場廣泛應(yīng)用,而應(yīng)用于疾病檢測以及藥物治療才逐漸開始。

微生物的未來市場容量大,增速快。上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院微生物學(xué)特聘教授、美國微生物科學(xué)院院士趙立平教授表示,微生物組學(xué)將會是一個萬億級別是的市場9。根據(jù)Transparency Market Research的調(diào)研分析,人體微生物市場主要為診斷和治療兩個方向,預(yù)測2020年到2024年的復(fù)合年均增長率9.2%10。據(jù)廣證恒生預(yù)測,微生物治療領(lǐng)域的全球市場空間在2026年有望達到100億美元11

根據(jù)Global Engage的部分統(tǒng)計數(shù)據(jù),從2010年開始,近18億美金的風(fēng)投資金(種子輪到C輪)涌入微生物產(chǎn)業(yè)12?(圖7),2016年到2017年就占了10億美金。4個應(yīng)用領(lǐng)域中,微生物治療成為投資熱土,占總投資額的61%,其次是臨床診斷(18%), 農(nóng)業(yè)應(yīng)用(12%),消費級產(chǎn)品(9%)。

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圖7. 全球微生物投資領(lǐng)域分布(2010-2017)

微生物診斷及治療占了總投資額度的大概三分之二,而這兩個領(lǐng)域的投資輪次以種子及A輪為主,說明產(chǎn)業(yè)化還尚屬早期(圖8)。 自2013年開始,早期投資的數(shù)量(種子及A輪)逐年穩(wěn)定上升。從2015到2017年,中后期的B和C輪投資數(shù)量呈明顯上升趨勢,某種程度上說明微生物產(chǎn)業(yè)化在穩(wěn)定發(fā)展中?(圖8)。

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圖8. 微生物診斷及治療領(lǐng)域的投資階段(2010-2017)

2010-2017的主要投資人包括Seventure Partners (15 輪), Flagship Pioneering (10 輪), OrbiMed Advisors (8 輪), Alexandria (8 輪), 以及Illumina Accelerator, Johnson & Johnson Innovation, and Monsanto Growth Ventures。這些投資人的投資領(lǐng)域都在涉及不同方面,?但是大部分都布局了治療領(lǐng)域,并且是輪次最多的領(lǐng)域,其次是診斷(圖9)。

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圖9. 微生物主要投資人及其投資領(lǐng)域分布(2010-2017)

國外微生物公司布局微生物治療, 國內(nèi)布局檢測及健康管理

CBinsights于2016年12月統(tǒng)計了24個獲得較好融資情況的微生物初創(chuàng)企業(yè),涉及7個領(lǐng)域,包括口腔,皮膚,腸道微生物健康,腸道微生物檢測,給藥系統(tǒng),食物補充,以及通過微生物做診斷(預(yù)測IVF成功率)(圖10)13。

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圖10. 微生物創(chuàng)業(yè)公司所針對人體領(lǐng)域的分布

由于此數(shù)據(jù)到2016年底,并且沒有太多中國公司的信息,我們進一步收集了2018年8月前創(chuàng)辦的,有比較好投融資情況的微生物初創(chuàng)企業(yè)。我們共收集了18家國內(nèi),46家國外公司(36家來自美國,10家來自歐洲或加拿大)。

在統(tǒng)計的18家國內(nèi)公司中,83%的公司創(chuàng)立于2013年至2018年之間,集中在北京(5家),廣東(7家)以及江滬一帶(6家)。公司業(yè)務(wù)分為:檢測,診斷,技術(shù)平臺,以及治療。中國微生物公司主要布局檢測,共13家(72%),主要提供科研服務(wù)或者腸道菌群檢測的健康管理的服務(wù)和產(chǎn)品(圖11)。市面上暫時還沒有拿到CFDA認證的檢測產(chǎn)品。微生物治療領(lǐng)域有2家公司(6%):奕景生物-艱難梭菌和潰瘍性結(jié)腸炎,知易生物-治療抗菌藥相關(guān)性腹瀉和難辨梭菌相關(guān)性腹瀉,并在11月其創(chuàng)新活菌藥物 SK08 臨床申報獲得受理。診斷方面有1家公司,技術(shù)平臺型公司有2家:1個是廣州的穆恩生物,專注于提供菌群的分離和培養(yǎng),提供產(chǎn)業(yè)化、產(chǎn)品化解決方案;另一家是深圳的未知君,做腸道微生態(tài)的AI制藥平臺。規(guī)模方面,2家為新三板上市,市值8000萬和1.2億。其他公司在 pre-A輪的融資額在千萬元以內(nèi)。值得關(guān)注的公司包括有技術(shù)優(yōu)勢的檢測性公司以及專注于制藥的公司,如銳翌生物、譜元科技、諾輝健康、知易生物、奕景生物等。

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圖11. 國內(nèi)外微生物企業(yè)業(yè)務(wù)領(lǐng)域分布

國外公司中,美國微生物初創(chuàng)公司有36家,歐洲有10家,其中法國有5家,英國2家,加拿大,瑞典,荷蘭各1家。在業(yè)務(wù)領(lǐng)域方面的分布方面,國外呈現(xiàn)非常不同的分布。30家(65%)的國外初創(chuàng)企業(yè)布局微生物治療,檢測只有7家(15%),微生物相關(guān)技術(shù)(如數(shù)據(jù)庫及數(shù)據(jù)分析,口服制藥技術(shù))有3家(7%),益生菌保健品等有3家(7%),微生物診斷公司有3家,占比7%(圖12)。值得一提的是,微生物診斷的2家美國公司,metabiomics-結(jié)直腸癌早篩,以及OmniBiome Therapeutics-早產(chǎn)兒診斷, 在近2、3年均沒有線上報道,公司網(wǎng)站也沒有再更新。但是從FDA今年9月開辦的針對腸道微生物的workshop的反饋情況,目前有不少的公司在申請通過腸道微生物做疾病診斷方面的應(yīng)用,預(yù)計1-2年內(nèi)應(yīng)該會有診斷產(chǎn)品的出現(xiàn)。

美國腸道微生物企業(yè)的規(guī)模范圍大,有4家NASDAQ上市公司,其他企業(yè)A輪融資在數(shù)百萬到數(shù)千萬不等。值得關(guān)注的公司包括:Evelo Biosciences,Seres Therapeutics , uBiome, Blue Turtle Bio, Kallyope, Synlogic,F(xiàn)inch Therapeutics,Eligo Biosciences(法國)等。

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圖12. 國內(nèi)外微生物企業(yè)業(yè)務(wù)領(lǐng)域分布

國外治療公司布局多個疾病領(lǐng)域,最多的是腸炎及癌癥

我們進一步分析了美國做微生物治療的企業(yè)。在涉及的治療領(lǐng)域,24個微生物治療公司中,有15家涉及開發(fā)腸道炎癥相關(guān)疾病,最常見的包括炎癥性腸炎(Inflammatory bowel disease-IBD),潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis-UC),克羅恩?。–rohn’s disease-CD),腸易激綜合征(Irritable Bowel Syndrome-IBS),艱難梭菌(C.difficile),以及脂肪性肝炎(NASH)。其次涉及數(shù)量最多的領(lǐng)域是腫瘤 (7家), 皮膚類和代謝類有4家,中樞神經(jīng)相關(guān)的有3家(圖13)。其他適應(yīng)癥包括菌群耐藥性,苯丙酮尿癥,罕見病如高雪氏癥,灰質(zhì)病等。大部分公司的產(chǎn)品線一般布局2-3個領(lǐng)域,最常見的是腸道炎癥,腫瘤,代謝類疾病。

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圖13. 美國微生物治療公司涉及治療領(lǐng)域

在臨床方面,腸道炎癥和其他適應(yīng)癥相比也走的最快,已經(jīng)進入III期臨床,公司包括:Seres Therapeutics – 治療反復(fù)艱難梭菌感染;Second Genome – 治療NASH以及IBD。Rebiotix – 治療感染、腸炎。癌癥以及自身免疫方面的應(yīng)用還屬于I期,中樞神經(jīng)類的應(yīng)用還在臨床前研究階段(圖14)。

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圖14. 美國微生物治療的臨床進展

具有菌株篩選及制藥平臺的公司最具發(fā)展?jié)摿?/section>

美國的微生物治療類公司可以大致分為三種類型:

第一種,有自己的菌株庫以及篩選、制藥平臺,具備技術(shù)優(yōu)勢。如Vedanta, 有自己的菌株庫,自主研發(fā)的生信分析以及數(shù)學(xué)模型,以及制藥設(shè)施。Second Genome組建了一個能夠用于藥物研發(fā)的微生物組發(fā)現(xiàn)平臺(Microbiome Discovery Platform),通過了解人體內(nèi)微生物的組成和功能,比較它們在健康人體和患者間的不同,微生物之間的互動,找到與人類疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)、肽類以及代謝物等生物標(biāo)志物。這一類的公司也最受投資人青睞,如second genome在A輪融資1150萬美元,B輪5140萬美元。

第二種是圍繞某一種菌株開發(fā)藥物,如ViThera圍繞Lactococcus Lactis 做藥,Symbiotix Biotherapies圍繞脆弱擬桿菌Bacterioides fragilis做物。但是這種公司未來的應(yīng)用場景將會收到較大的局限。

第三種是針對特殊人群。例如,Synlogic希望通過設(shè)計改造的益生菌用來精準治療新生兒的尿素循環(huán)障礙、苯丙酮尿癥兩種罕見疾病。但是這種應(yīng)用也將會受到用戶群體數(shù)量的限制。

國內(nèi)外呈現(xiàn)極大不同的布局,是多方面影響的結(jié)果

首先,由于政策成熟度的不同,國內(nèi)的公司在布局治療領(lǐng)域方面會面對更大的政策不確定的風(fēng)險。美國的藥物審批流程相對成熟,對待腸道菌群治療是持有開放、積極的態(tài)度。2013年,F(xiàn)DA將糞菌移植寫入美國復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染的治療指南,作為治療的最后一道防線。在美國,糞菌移植是按照新藥申請流程的,F(xiàn)DA在2016 年也制定了LBPs的早期臨床試驗的CMC指南。在2018年9月召開的workshop中,F(xiàn)DA也在積極的與微生物制藥公司商討相關(guān)的政策審批方面的制定,相信不久,腸道微生物制藥的相關(guān)審批政策將會出臺。在國內(nèi),糞菌移植和活菌藥物暫時還沒有明確的規(guī)定,CFDA對于腸道微生物治療的態(tài)度也不明確。糞菌移植的使用歷史雖然可追溯到至少公元四世紀的中國,但是目前暫無確切的管理條例,只作為一種醫(yī)療技術(shù)而不是藥物,不需通過藥監(jiān)局批準而進行臨床試驗11。各個醫(yī)院自己進行治療,沒有統(tǒng)一的標(biāo)準,因此治療效果也較為不穩(wěn)定。

第二,科研資金、投資支持力度的不同。華大基因參與了歐盟MetaHIT的科研項目,科研基礎(chǔ)和國外應(yīng)該是同步的,但是在后續(xù)的科研支持以及產(chǎn)業(yè)化方面,美國的政府資金以及社會資金的支持遠遠超過國內(nèi)。

第三,微生物的工業(yè)化技術(shù)限制。微生物的工業(yè)化技術(shù),包括菌株的分離、發(fā)酵培養(yǎng)、制劑和劑型保護等,是產(chǎn)業(yè)化的畢竟之路。而現(xiàn)在這些技術(shù)都在國外的公司里面,如丹麥,美國,加拿大,中國這方面的技術(shù)人才較為缺乏。國內(nèi)的穆恩生物專注于解決這一步驟的難題,其技術(shù)平臺包括菌株的分離、保存、篩選、功能分析、以及進行部分量產(chǎn),這一技術(shù)平臺將能幫助微生物產(chǎn)業(yè)的上下游對接。

由于以上三點的區(qū)別,造成了國外公司主要布局治療,而國內(nèi)公司主要布局檢測的局面。但是微生物要真正實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的發(fā)展,僅僅是做檢測腸道健康類的產(chǎn)品是遠遠不夠的。

我們將在下一篇中對國內(nèi)微生物公司面對的產(chǎn)業(yè)化的瓶頸、未來應(yīng)用的場景,以及我們認為值得投資的標(biāo)地一一進行探討。

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